随着2002年下半年以来我国面临流动性过剩，特别是2005年汇率形成机制改革以来国际收支双顺差压力进一步加大，中央银行需要足够的债券资产进行流动性对冲操作。不过，由于财政部门国债发行仅考虑自身融资需求，国债期限过长、数量偏少且国债发行并不规律，国债市场的广度、深度无法满足央行和金融机构交易需求，中央银行不得不通过发行央票方式进行流动性对冲。针对发改委和证监会对企业信用债管制过严导致市场发展受限，中国人民银行分别在2005年和2008年引入短期融资券和中期票据市场。同时，为更好地发挥市场作用，2007年成立了银行间市场交易商协会，通过市场自律方式促进债券市场规范发展，实行企业债务融资工具发行注册制。全球金融危机后，借鉴国际经验于2009年成立了以中央对手为主的集中清算的上海清算所，进一步规范了债券市场发展。银行间市场的发展有效推动了有关部门放松过严的市场管制，中国债券市场规模在很短的时间就上升至全球第三位。银行间债券市场迅速发展并成为我国债券市场的主体，为推进利率市场化、畅通利率传导机制，发挥了重要的作用，但我国金融市场仍存在市场分割、深度不够等问题，影响到了市场利率的有效形成及货币政策的顺畅传导，具体表现在： 一是我国货币市场和债券市场仍被人为分割。我国货币市场和债券市场一直存在着银行间和交易所两个完全不同的市场。由于两个市场准入和监管存在明显差异，市场价格分化明显，这进一步助长了市场的监管套利。特别是，交易所市场信用风险溢价较高，利率水平和波动都明显高于银行间市场，干扰了市场预期和中央银行的流动性管理。例如，近年来中国人民银行通过逆回购、SLF和MLF等工具有效引导存款类金融机构质押式回购利率水平，并在2017年5月推出了银行间回购定盘利率（FDR）和以7天银行间回购定盘利率（FDR007）为参考利率的利率互换产品，但2016年底以来，存款类金融机构质押式回购利率（如DR001和DR007）与全部银行间市场质押式回购利率（R001和R007）价格背离趋势明显，这也反映了影子银行规模扩大和金融风险集聚下，不同类型金融机构市场分割进一步加剧。

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