财税体制的影响也十分明显。四大直辖市和深圳、厦门、宁波等计划单列市等，因为财税体制上直接与中央分成，所以自身留成比例高。比如，厦门的GDP在全国仅位居第50位左右，但财政收入却高居第17位。

相比之下，其他城市在上交中央财政的同时，还要上交省级财政，所以留成比例要低不少。在这种情况下，城市所在省的区域发展均衡情况，也会对城市的财力产生较大影响。如果所在省的区域发展较为均衡，那么省级财政的转移支付压力就会小很多，作为发达中心城市，上交省级财政的比例也会小一些。比如杭州和南京所在的省份，区域发展相对均衡，这两个城市的负担也会小一些。

相反的，如果所在省的区域发展差距较大，那就需要更多的省级财政来转移支付，帮助省内欠发达地区，尤其是在省内有计划单列市的情况下，一些省会城市、经济大市就要做出更多贡献。

这其中的典型就是广州。经济总量排名第4位的广州，其地方一般公共预算收入仅排第8位，在杭州之后。但这不说明广州的经济发展不如杭州，或者说广州的GDP含税率不如杭州。事实上，广州每年产生的财政总收入要比杭州高了近一倍。

2018年，广州的财政总收入合计6205亿元，其中约四分之三要上交中央和省，自己只留下约四分之一。而同期杭州财政总收入3457.46亿元，仅为广州的56%，但杭州一般公共预算收入达1825.06亿元，比广州高出193亿元，自留的比例达到了53%。也就是说，广州本身产生的财政收入并不少，但自留的比例比较低。

广东体改研究会副会长彭澎表示：“需要广州扶持的是一个比全国平均水平还要低很多的粤东西北地区，它们需要大量的省级财政转移支付来支持。此外，计划单列市深圳不用上交省级财政，因此广州的压力非常大。”

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