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作为中科院昆明动物研究所访问学者,艾斯迈利扎德教授此前针对开心果做了大量研究工作,积累了不同品种种子和表型的大量数据。结合昆明动物研究所的基因组学和进化生物学学科优势,双方展开了合作。他们利用二代及三代测序技术绘出了开心果基因组草图,比较基因组的分析结果表明,开心果对环境压力的适应性可能与细胞色素P450和几丁质酶基因家族的扩增有关。针对耐盐实验前后的样本进行的比较转录组学研究,他们还发现茉莉酸生物合成途径在开心果耐盐性中起着重要作用。
“我们还对93个栽培种、14个野生种以及35个与野生开心果近缘物种进行了重测序,揭示了开心果的群体结构特征、遗传多样性以及驯化。”参与此项研究的吴东东博士说,他们发现在不同的野生开心果物种之间,存在频繁的遗传物质交流。比较群体基因组分析显示开心果大概在距今8000年前开始被驯化,并经历了二段式的驯化过程,一些古老的栽培品种显示与野生种具有更近的亲缘关系,而广泛栽培的品种则是经历了后期的育种以及改良。
研究中,他们还鉴定了驯化过程中受到人工选择的、与树体和种子重量、植株大小相关的关键基因。这些基因在开心果驯化过程中,与人工选择作用和农业经济性状密切相关。相关成果在线发表于权威期刊《基因组生物学》上。
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