根据证监会的调查资料显示，为了扭转公司的亏损，时任董事长周旭辉在2014年年初定下了公司当年利润为3000万元左右的目标。不过，实现的方式，却是通过做假账。

公司会计核算设置了006和003两个账套，003核算的数据用于内部管理，以真实发生的业务为依据记账，006账套核算的数据则用来对外披露，其中的数据则是经过粉饰和伪造。

每个季度末期，公司的财务负责人会将真实利润数据和按照年初确定的年度利润目标分解的季度利润数据报告给周旭辉，而后由周旭辉来决定当季度对外披露的利润数据。

周旭辉确认季度利润数据之后，公司财务人员再按照此数据要求，虚增收入、成本，配套的虚增存货、往来款和银行款，计入账目中。

按照这样的方式，2015年4月1日公布的公司2014年年报中，公司的利润总额实现超过7000万元，比2013年的亏损1.27亿元大幅度增长，并扭亏为盈。而实际上，公司2014年实现的利润总额的真实数据为亏损480万元左右。

2015年6月4日，证监会对金亚科技立案调查，公司股价也已经从68元的高点连续下跌到3.14元。

2018年3月1日，证监会对此案作出处罚，对周旭辉处以90万元罚款，并对其采取终身证券市场禁入措施，对公司其他责任人则分别处以30万元到10万元不等的罚款，以及5年或10年的市场禁入措施。

6月5日，又对时任公司董事的周良超处以25万元的罚款，并给予警告，原因是周良超在公司财务造假的2014年年报上做了书面签字，属于“其他直接责任人员”。

已于6月25日停牌的金亚科技称，公司股票将于2018年6月26日继续停牌，并将于6月27日开市起复牌，交易30个交易日后，预计于8月8日开市起停牌，“深交所在公司股票停牌后15个交易日内作出是否暂停股票上市的决定。”

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