值得注意的是，建设全国碳排放权交易市场是一项非常复杂的系统工程，尤其是在新形势下有诸多难题待解决。据《经济参考报》记者了解，在电煤价格全程高于国家发改委规定的绿色区间的情况下，今年火电行业亏损面仍接近一半，预计全年累计亏损数百亿。

“当前发用电计划逐步放开，火电企业开始自主参与电力市场化交易，而且在清洁能源加大利用的情况下，火电机组利用小时数逐年降低，面临着一定的经营压力。在这种情况下，碳市场成本怎么传导，难度会进一步加大。”国网能源研究院有限公司副总工程师兼企业战略研究所所长马莉称。

华能碳资产经营有限公司总裁助理钟青认为，如果全国市场配额的分配仍然与试点地区分配松紧程度类似，短期来看碳市场发展对火电行业经营不会构成特别大的影响，但从中长期来看，将给整个行业发展带来根本性、变革性的影响。

与此同时，新一轮电改在发电和售电侧同时引入竞争，开展中长期交易，8个省电力现货市场试点也在推进过程中，预计明年上半年都要进入试运行，未来可能进一步增加或推广。

“电力现货市场试点和碳市场试点的范围不一样，会导致一些问题，比如不同省份。”马莉指出，市场化电力交易下发电出力和电力流向的不确定性提高，导致发电企业对碳排放的预测难度会加大。而且，市场主体多元化带来了碳市场的定位和履约的问题。在她看来，碳市场和电力市场同时推进，要充分考虑两个市场的协调发展问题。

面临挑战的还有与碳市场、可再生能源市场以及排污交易市场等的融合。清华大学能源环境经济研究所副教授周剑表示，国内可再生能源的支持政策即将转向，传统的固定电价补贴政策将退出历史舞台，未来将施行以配额制加绿证的政策机制。全国碳市场建设进程需进一步加快，扩大行业的覆盖范围，同时，顶层建设方面还要进一步加强，需要考虑跟未来其他政策的融合问题。据悉，京张地区将试点衔接绿电交易和碳交易。

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