中国食品产业分析师朱丹蓬赞同上述观点，“五谷磨房最大的优势在于其线下布局完善，每个门店都有促销员、驻店人员，有利于其产品和品牌的推广。” 朱丹蓬强调，中国农产品毛利很低，产业结构较为低端，这样的情况给定位于农产品精加工的五谷磨房提供了很好的利润土壤。但其主要的毛利不是源自农产品本身，而是渠道、包装、加工、品牌等方面的附加。

不过，蒋军还提出，虽然五谷磨房已经做到了申请上市的阶段，但公司面临一个非常矛盾的问题：个性化产品，难以标准化。“如果一家企业要做大做强，必须走上标准化的道路，而这跟个性化是矛盾的，五谷磨房也在为此寻求解决方案。另一方面，五谷磨房的模式独特，却是可复制的，并且独立性差，必须依赖于大平台，也难以做成刚需(目前只是选购品)，就这些来说，它(上市后)还是任重道远”。

此外，科信食品与营养信息交流中心科学技术部主任阮光锋也提醒消费者，与一般购买的全谷物不同的是，为了便于食用，五谷磨房的产品大多经过磨碎，有些会加糖。而磨碎和加糖，反而改变了谷物本身的消化特性，使得该食品更易消化，人食用后血糖也可能升高，食用五谷的本意(吸收慢等)打了折扣。

“不过，从健康角度来说，该类食品仍然可以作为日常健康膳食的一部分。”阮光锋如是表示。

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