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哈佛刘小乐：免疫治疗只能助攻抗癌， 病人需“每人一味药”
2002年获美国斯坦福大学生物医学信息学博士与计算机科学辅修博士学位的刘小乐，首先是一位生物学家，其在1992年考入北京大学生物系。两年后，刘小乐进入美国史密斯学院，随后在那里获得了生物化学与计算机科学双学士学位。
多学科背景的刘小乐最终选择以生物医学信息开启职业生涯。“工作之后的10年时间里基本都在做一些非常基础的工作，近年才开始和临床医生真正展开合作。”刘小乐提到，“很少有人能把基础和临床很好地结合起来，都懂一些能够做得更好。”
就在肿瘤免疫疗法被选为十大科学突破之首的第二年，刘小乐在学术会议上听到了免疫治疗先驱、美国国家癌症研究所（NCI）Steven Rosenberg等人讨论如何针对病人找特异性免疫治疗的办法，“当时我觉得太兴奋了，一定得好好做，如果他们真的找到了办法，我们就没工作了。”
刘小乐想到的是目前的治疗还不够精准。“如何在给病人用药以前，就能预计病人对药物的反应？找到相关生物标志物是一个重要的问题。”已知的生物标志物包括肿瘤里T细胞水平，即到底有没有“哨兵”； T细胞多样性；肿瘤变异的多少等。
除此之外，刘小乐团队认为，在对肿瘤的测序中，不仅看肿瘤DNA的变异，还需要看基因的表达，即对RNA测序。
以转录组RNA-seq（转录组测序技术）大数据为基础，刘小乐团队开发了三项重要算法研究成果，分别是TIMER、 TRUST和TIDE。这三种算法分别能精准确定肿瘤组织内免疫细胞浸润度、精准鉴定肿瘤组织中的免疫组库，以及有效地预测病人对现在的免疫抗体药物会不会获益。
以TIMER算法为例，“我们从肿瘤RNA测序里大概算出里面有多少T细胞、B细胞、巨噬细胞等，这就能掌握病人的肿瘤微环境大致是怎么样的。”而所谓的肿瘤微环境尤其是对免疫治疗的有效性来说会起到至关重要的作用。
