中国水稻研究的奠基人丁颖曾极力主张水稻原产中国。此番论文中也提到，亚洲栽培水稻中“籼”、“粳”两大亚种早在2000多年前的汉代已被人们所认知。丁颖也特意把籼稻定名为籼亚种，粳稻定名为粳亚种。

但籼/粳稻的起源和命名在国际上一直极具争议。

1928年，日本学者加藤茂范通过杂交等手段发现了籼稻和粳稻的区别。然而，加藤随后把籼稻称为“印度型” （Oryza sativa L. subsp. indica Kato），把日本栽培极广的粳稻称为“日本型” （Oryza sativa L. subsp. japonica Kato）。自此，籼稻和粳稻在国际上就一直沿用“indica”和“japonica”命名至今。

研究团队认为，这两个亚种用“印度”和“日本”来命名，很容易使人误解籼粳的亲缘关系、地理分布和起源。

研究团队在这项研究中对亚洲栽培稻群体的结构和分化进行了更为细致和准确的描述和划分，由传统的5个群体增加到9个。分别是东亚（中国）的籼稻、南亚的籼稻、东南亚的籼稻和现代籼稻品种等4个籼稻群体，东南亚的温带粳稻、热带粳稻、亚热带粳稻等3个粳稻群体、以及来自印度和孟加拉的Aus和香稻。

另外，通过对大量和驯化进化相关基因的单倍型和泛基因组分析发现，籼稻携带的很多基因不存在于粳稻中，粳稻的很多基因也不存在于籼稻中。此外，不同地理来源的水稻农家品种群体都带有特异的基因家族。

根据这些结果，研究团队首次提出了籼、粳亚种的独立多起源假说，并恢复使用籼 （Oryza sativa subsp. xian）、粳（Oryza sativa subsp. geng）亚种的正确命名。

据韦朝春透露，因为命名问题，《自然》编辑及文章审稿人曾多次和研究团队沟通，起初并不认可这种修正。“但黎志康老师坚持要把之前的误导性命名改过来，最终说服了对方。”

研究团队认为，正确命名使得中国源远流长的稻作文化得到正确认识和传承。

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