从1999年4月设立至2000年1月，陈奇星一直持股50%为公司第一大股东。2000年1月，第一大股东变更为徐同生。变更成员前，杨振宇为监事，于海为总经理，陈奇星为执行董事，江安全和叶和兵为监事；而变更成员后，陈奇星为公司董事长，陈龙发、杨荣和徐同生为董事，宣润兰、丁加斌和薛莉为监事，刘钢为总经理、董事。

2001年3月，公司股东再次发生变更。徐同生将其所持的32%出资额转让给陈龙发，将剩余所持的3%出资额转让给陈奇星，并不再担任董事，此时陈龙发持股达到40%，成为第一大股东。同年8月，董事长陈奇星和董事杨荣又分别将其所持的32%以及8%的出资额转让给陈龙发，但陈奇星仍然担任董事长，而陈龙发持股一度达到80%。

令人诧异的是，2005年8月，陈龙发、杨荣、刘钢分别与突然冒出的“神秘人”舒持连签署了《股权转让协议》，转让后，舒持连持股达到52%，成为菲菱科思有限的新任第一大股东。此次股东变更后，陈龙发为公司董事长、总经理、董事，舒持连和高国亮为公司董事，宣润兰和丁加斌不再担任监事，改由徐坚和丁俊才担任。从此，陈奇星彻底从菲菱科思有限“退出”。

2015年6月，菲菱科思有限只剩两大股东，分别为持股占比54.74%的舒持连和持股占比45.26%的陈龙发。当年7月，菲菱科思有限召开股东会，同意舒持连将其持有的共计54.74%的出资额分别转让给陈曦、高国亮、蔡国庆、陈美玲、宣润兰、舒姗、刘雪英以及贺洁共计8位自然人，股权转让后，上述受让方分别持有26.43%、9%、7%、4.31%、2%、2%、2%以及2%。

2016年2月19日，经股东会决议，菲菱科思有限整体变更设立股份公司，公司的控股股东、实际控制人为陈龙发，其直接持有公司42.26%的股份；陈曦则为第二大股东。而公司的高管也随之改变，其中陈龙发为董事长、总经理，蔡国庆为董事、副总经理，江安全为监事。

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